Die Holzsammlung (Xylothek) mit geschätzten 20 000 Einheiten ist eine getrennt aufgestellte Sondersammlung des Herbariums Berolinense (B) und möglicherweise die zweitwichtigste Sammlung ihrer Art in Deutschland. Interessant für die Forschung ist die Sammlung unter anderem im Kontext Kolonialismus und den Brandverlusten von 1943, da alte Holzproben mit verloren gegangenem Herbarmaterial oder nicht mehr vorhandenen Pflanzen aus der Lebendsammlung des Gartens korrelieren. Zusätzlich hat die Sammlung auch eine große Bedeutung für historische und restauratorische Fragestellungen. Bislang ist die Sammlung durch handgeschriebene Karteikarten erschlossen und wurde zuletzt 1958 revidiert.
Zur digitalen Erschließung der Holzsammlung wurde die Kartei 2023 zunächst gescannt. Nun werden im Rahmen der Zusammenarbeit zwischen dem Digitalen Netzwerk Sammlungen und dem Botanischen Garten und Botanischem Museum Berlin die handhandschriftlichen Informationen auf den Karteikarten mit Hilfe von KI ausgelesen. Die Ergebnisse dieser ersten maschinellen Erfassung werden zusammen mit den Bilddigitalisaten der Karten in einem Online-Tool zur weiteren Verarbeitung und Korrektur bereitgestellt. Ziel ist es eine vorläufige Datenbank herzustellen, die die geplante Inventarisierung der physischen Sammlung erleichtert.